元朝在西藏设置了什么机构？

元朝在西藏设置了：宣政院。

宣政院所辖吐蕃之地，分设三道宣慰司。元朝统一藏族地区后，扶植萨迦派建立地方政权，同时元朝在青藏高原设立了一系列的军政机构。

到元朝中期时，整个青藏高原被划分为三个行政区域：“朵思麻宣慰司”、“朵甘思宣慰使司”、“乌思藏宣慰司”，三道宣慰司管辖边疆少数民族地区的军政事务，隶属于宣政院，属地方行政机构。

宣政院历史评价

藏学学者陈庆英：宣政院是一个常设的中央管理机构，是元朝在中央政府中设置的掌管全国佛教事务以及藏族地区军民之政的特殊机构。由于职掌的特殊性，从用人、奏事等方面而言，它成为与中书省、枢密院、御史台并列的四大军政系统之一，这在元朝以前是没有过的。

中国藏学研究中心历史研究所所长张云：宣政院，以及它的前身总制院，上承唐代之旧，下启明清之新，在历代中央政府的治藏机构中，也是颇具特色的一个，值得深入研究。