农民在承包地种植苗木花卉违法吗？土地经理说这是违法的。

根据《土地管理法》第三十六条:“非农业建设必须节约用地。能利用荒地的，不得占用耕地；能利用劣质地的，不得占用好地。

禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土。

禁止占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼。"

据此，在承包耕地上种植苗木花卉并未破坏耕地结构，其行为不违法，土地管理人员的说法是错误的。