南京博物馆展览
上世纪60年代初，以“江苏历史展”为基本陈列，以近3000件考古、民族学文物和历史文献为主要展品，展示江苏的政治、经济、文化发展史。经过修改、补充、完善，1989更新为“长江下游五千年文明展”，将展览区域扩大至长江下游，包括江苏、安徽、上海三省及浙江、江西部分地区。同时增加“江苏考古展”和“我们的昨天——祖国历史民族文化展”两个基础展。
1999艺术展览馆建成对外开放，展览面积7000平方米。设有11珍品、玉器、青铜器、明清瓷器、书画、陶器、漆艺、刺绣等专题展厅，多年展出珍品5000余件，陈列精美，品味高雅。自开放以来，受到了社会各界的好评和欢迎，被国家文物局评为“1999年中国十大优秀展览”。
南京博物院每年还举办40场左右的临时展览，包括本馆收藏的文物特展、外省市文物精品展、当代艺术家作品展和国外有影响的艺术展等。明清瓷器博物馆
瓷器是新入选的中国古代四大发明之一，也是让世界了解中国最具代表性的古代贸易商品。南京博物院藏瓷器丰富精美，多为明清官窑传世。明清瓷器展厅展出了近600件精选展品，从明代洪武到清代宣彤。展品包括青花、五彩、釉下红等十余种精品，其中不仅有迄今发现的最早的釉上红残盘，还有古玩界追捧的珍贵搪瓷碗。展览主线清晰，展示的展品种类丰富，让人倍感舒适。
青铜博物馆
南京博物院青铜器展厅陈列的青铜器，都是江南出土的精品青铜器。它们不同于北方，表现出江南特有的小而美的器物特征。展品从商代晚期到东汉时期，分五部分展出:酒食器具、乐器、军乐器、厕所和陈列。在博物馆里，有一个镶嵌着竖鸟几何图案的青铜壶。通体饰以错银，覆以绿松石。壶形纤细灵动，采用青铜器中少见的束腰造型。锅底由三只传说中的猛禽组成，锅顶中央蔓延的鸿雁象征着远大志向，是战国时期只有高级贵族才能享用的物品。这些精美的青铜制品像一面镜子向我们展示了中国青铜时代的礼乐文明。
陶艺馆
陶器博物馆展出了近100件从新石器时代到明代的陶器珍品。比如，猪形陶罐、陶豆是当时古人的日常用品，馆内汉代陶女活泼好动，生活气息浓厚；唐代的舞女、兽女、三彩充分反映了盛唐时期高度发达的经济。中国古代陶瓷艺术不仅是一部艺术史，更是一部社会生活史，是我们认识古代社会生动形象的一幅风俗画卷。
江南锦绣馆
云锦是南京的特产，因云美而得名“云锦”。它与苏州的宋锦、四川的蜀锦并称为中国三大名锦，位列中国三大名锦之首。在南京云锦申报人类非物质文化遗产之际，南京博物馆从馆内数百件文物中精心挑选了100余件代表性作品进行展示，让人们直接了解云锦工艺的文化内涵。云锦馆内有大型织锦提花织机，现场演示云锦的制作工艺。云锦制作是中国唯一不能被机器替代的编织工艺。两个人互相配合一天只能织5-6厘米，所以有“寸锦为寸金”的说法。云锦阁二楼刺绣室有丰富多彩的苏绣产品，观众还可以欣赏到绣娘的现场表演。
玉石博物馆
中国玉有着8000年的悠久历史，在人类文明史上占有重要地位。古代玉器，成套玉器，斧子驰骋；中古玉，求同存异，推陈出新；现代玉器，发扬传统，与世界文化融合。南京博物馆玉器展厅展出了600多件立足时代的精美玉器，为观众了解丰富多彩的玉器文化提供了平台。在这里，观众可以欣赏出土的古代玉器，宫廷流传下来的奢华物品等等。中国玉以其独特的魅力吸引着全世界人民的目光，并逐渐成为人类的共同财富。
古画画廊
古代书画馆作为南京博物院的专门展厅，不定期展示不同时期的特色书画，包括清代四僧书画展、金陵八大画展等。中国古代绘画始于五代，成熟于唐宋，宋元时期获得空前发展，明清时期达到中国绘画史上的顶峰。出现了像吴派这样的书画大流派，对后世的绘画艺术产生了深远的影响。展厅展出了沈洲、文徵明、唐寅、仇英和张虹等著名艺术家的作品。博物馆的每一个特展都是在对外开放前精心挑选和安排的，让书画爱好者以最直接、最直观的方式了解古代绘画艺术，同时也为公众艺术交流开辟了新的途径。
漆艺画廊
中国是世界上最早知道和使用漆器的国家。古代人用的是漆树分泌的天然漆，也叫生漆。最早的漆器出土于浙江余姚河姆渡文化遗址，距今已有7000多年。南京博物院漆器馆展出了100多件不同时期风格各异的漆器。在展出的文物中，有精美的汉代七连、光泽如新的南宋圆形漆器盒、独具特色的明代螺钿镶嵌屏风等。其中一个作为御膳点心盒的是清代雕花山水人物盒，气势恢宏，引人注目。漆雕就是把轮胎一层一层的涂上去，每一层都放入专门的储存窑中固化，刷到一定厚度后再开始雕刻。封面上刻有100多个亭台楼阁，回廊蜿蜒，百余人穿行其中，形成一幅热闹喧闹的园林图。画一两百层就能做出这样的物件，需要两三年的时间。漆器博物馆里陈列的文物大致按照朝代分类，浓缩了中国几千年漆器工艺的精华。迷人的漆器不仅成为中国艺术史上辉煌的一页，也成为中国文化重要的精神内涵。
珍宝馆
珍宝馆是南京美术馆中最高的博物馆，大部分展品都是南博一级文物和国宝。也是时代精神和社会进步的标志。展品囊括了各个时期的文化精髓，有良渚时期的玉杯玉琮，明代的镀金喇嘛塔，清代的玉珠。东汉铜牛灯之一，不仅设计精巧，而且具有独特的环保意识，在世界灯具史上一直处于领先地位。直到15世纪中叶，西方国家才发明了一种铁导烟灯，比中国晚了1500年。聚宝堂，集历代之精华，可以说是中国古代人文胸怀的结晶。它见证了中国文化的悠久历史，成为历史长河中耀眼的证明。
民间艺术博物馆
南京博物院著名的大众艺术展览馆在全国是首创的。根据民俗文物的用途，基本分为民间服饰、生活用品、生产工具、季节性装饰品、娱乐用品、祭祀用品等部分，展现了我国丰富多彩的民俗文化。从栩栩如生的无锡泥人到巧手剪纸等等，展厅陈列古色古香，营造出一种具有民间特色的氛围，给人耳目一新的感觉。
吴为山雕塑博物馆
吴为山文化名人雕塑馆是由诺贝尔物理学奖获得者杨振宁博士命名的。馆内的40尊雕像，既是有形的，也是精神的，是从吴为山先生十三年创作的200多尊名人雕像中精选出来的，主要是江苏现当代文化名人，包括梅兰芳、徐悲鸿、匡亚明、林散之、吴健雄、杨振宁、费孝通等大师。吴为山的雕塑艺术已经成为中国当代文化的重要标志。
现代艺术画廊
现代艺术展厅是南京博物院第一个临时展区，定期展出南博承办的各类现代艺术展览和古代特展。参加过的展览有黄作品展、江苏国宝展、金色江南-江苏黄金展等。展览主题多样，内容丰富，增加了南博会的知名度和参观者的选择性。
沁园
南博展馆一楼走廊尽头的沁园，是吸取苏州园林“古、简、美、雅”的特点而建。苏州园林享有“江南园林天下第一，苏州园林江南第一”的美誉。园内鹅卵石铺成的道路蜿蜒向前，绿树成荫，回廊蜿蜒，溪水潺潺，美竹清凉，假山嶙峋，一口古井幽深。清代砖雕栩栩如生，描绘:春秋时期的历史，水浒传，秦淮故事等。除了参观，沁园也是你休息的好地方。
虚拟博物馆
虚拟博物馆的出现让用户通过上网就可以看到博物馆里各种精选的藏品，同时与虚拟现实的结合让虚拟博物馆更加强大。中央研究院开发了基于图像的高保真虚拟环境显示技术，为用户提供了观看虚拟场景时照片般逼真的视觉效果。以下将从环境电影的制作、环境电影与影像的整合、虚拟博物馆的延伸技术三个方面介绍中研院的相关先进技术，并以实例呈现。