1950年4月，遵照皖北行署指示，将站区派出所管理权限划归新成立的合肥站区。该区域管辖范围东起淮南铁路合肥段，西至合肥老城区东城门，南至郊区雷大营，北至合肥老火车站前的刘大营。东西跨度0.75km，南北跨度2.5km，面积1.875km2..全区辖15个行政集团，居民2410人。1953撤销辖区内15行政组，成立胜利路、车站、吴歌街、坝上街、吴尚街、河北街、崇德街、李三街8个居委会。后来1954增加了中心、合浦路、毛公桥三个居委会。1955，站区人民政府更名为站区人民委员会。其范围和组织保持不变。1956，本区新增七里站居委会。同时，吴歌、坝上、崇德、吴尚、河北五个居委会分别更名为邦宜、邦儿、滁州路、巢湖路、裕华桥居委会。1960年，该市开展公社运动，该区于当年6月5日改组为东石区人民公社(区人民委员会现仍存在。中共东市区人民公社委员会更名为中共东市区人民公社委员会。目前，公社下辖李三街、和平路、胜利路、东方红、华冲、大兴集、明光路、洪光等8个支部。1968 5月18，撤销东市区人民公社，成立东市区人民政府。蚌埠路472号，驻地办事处。当年9月3日，东石区人民公社所辖支部全部撤销，改为18街道委员会。其中6条是厂区的住宅街道。同年6月，本区所辖21农菜大队划为郊区。1965 7月，根据安徽省人民委员会关于设立街道办事处、增设居委会的指示精神，本区新增胜利路、李三街、华冲路、和平路4个街道委员会，居委会由之前的23个增加到42个。另外增加了合肥肉类联合厂、合肥造纸厂、合肥建材实验厂三个厂家属委员会。当时这个地区的人口达到85600人，比1，951增加了34.51倍。1966文革开始后，5月1967将该区划归军管，成立中国人民解放军合肥东区军管团，接管该区领导工作。1968年2月29日，军管组改为革命委员会。原辖区街道调整为9个街道革委会。即:七里站、和平路、大同路、火车站、胜利路、明光路、洪光、李三街、铜陵路。街道下面的居委会都是连队军办的。1973，恢复此设置，成立居委会。这期间，这个区有48个居委会。1979年，经安徽革委会批准，本辖区居委会扩大到55个。1980年6月，恢复了人民政府在这一地区的名称和编制。所辖街道和居委会于当年3月全部恢复了原名。1989年，本区成立了10居委会和71家委会，成立了安徽省首家军人家属服务中心。1999年5月，该区将所辖居委会调整为32个，后于2006年9月，将所辖的家委会、居委会整合改造为82个社区居委会。
2002年3月，合肥市区划调整，该区更名为合肥市瑶海区。瑶海区辖原东城和平路、胜利路、大同路、铜陵路、七里站、李三街、车站、明光路、洪光9个街道。从原郊区划分为城东1乡镇，七里塘、大兴两个镇，长淮、苗方两个街道。从原郊区划归杏花村镇板桥、王城店两个村，板桥河以东地区归七里塘镇管辖。由肥东县划入磨店乡(位于肥东县西部，与合肥市原郊区接壤，面积近50平方公里，人口2.6万)；肥东县龙岗镇管辖的三合、刘大营、油坊、大鹏、萝岗、马岗、王刚、石城8个村，新站、大店2个居委会划归大兴镇管辖(注:在移交过程中，鉴于移交地区龙岗开发区对肥东县经济的重要影响，应肥东县委、县政府要求 经市委、市政府协调，调整后瑶海区辖城东、磨店两个乡镇，七里塘、大兴两个镇，11街道，和平路、胜利路、大同路、铜陵路、七里站、李三街、车站、明光路、洪光、长淮、苗方。 面积142.90平方公里，人口36.53万，其中非农业人口28.82万。
2004年，城东街道办事处在城东镇成立。截至2004年底，瑶海区辖12个街道、2个镇、1个乡镇(含新站开发区下辖的长淮街道、苗方街道、七里塘镇)。
2005年，城东街道华冲社区和董琦社区分别划归铜陵路街道和七里站街道管辖，并划入大同路街道何裕路社区和明光路街道大王庙社区。铜陵路街道来安路社区、天长路社区归李三街街道管辖；车站街道河线社区、红星村社区归新站试验区管辖，新站试验区负责人槐街街道赵仓广场村民小组归车站街道管辖(暂由新站代管)；胜利路街道大窑湾社区4号门536号院居民小组归车站街道管辖，大同路街道铜陵村居民小组归和平路街道管辖。截至2005年底，瑶海区已划定，辖区东与肥东县接壤，西、南与贺飞河接壤，北与长丰县接壤，总面积142.9平方公里，辖13个街道和2个镇，人口38.3万人。其中，非农业人口28.83万人，占总人口的75.27%。