藏文版
到了明代，道教虽然逐渐失去了在社会和政府中的主导地位，势力开始衰落，但明代是整理和修订道教宗教典籍最重要的时期。今天我们所能看到的最完整、最大的道藏，就是在这个时期完成的。历代道教经书几经编纂，但由于历史原因，都失传了。于是在15世纪初，明朝永乐皇帝下令编纂道经。从1406-1445，历经数十年，终于完成了明代第一部道藏，是正统道藏。有5305卷，480封信。150多年后，万历皇帝再次下令编纂道经，在前一部的基础上增加了很多内容，就是“万历续道经”。明代这两部藏书共510封，5485卷。《正统道藏》共分十二部，包括三孔、四辅部，每部共收书1430种。洞穴有316种；有303种洞穴和奥秘；洞穴神有364种；太玄一百一十七种；太平系六十六种；台青署二十四种；同一本书有240种。但是正统道经的划分很混乱。比如《道德经》等道教教义应该列在道经第一栏，现在杜却被错误地列在道经第一栏。《上清经》是山洞的真实部分，现在大部分已经被误入第一部分；杜的学者们被关进了神秘的洞穴部，但现在他们却误入了真正的洞穴部。道家的诠释应该进入太玄部，但他们也误入了洞真部。这样的案例很多。因此，上述部门收到的图书数量已不能反映其图书的真实数字；上面收到的书的数量只是个大概。这些书很多只是一种，实际上包含了很多种。如《秀珍十书》收录了南宗后裔所收的《然后大集》、《上清集》、《玉龙集》、《武夷集》等十余种诗文。《七日云》是一部集书，不是节选就是全文，集书的数量更是不计其数。因此，实际收到的图书数量比上述数字要多。除了张玉初、、邵以正等人之外，参与编纂的道士还可考，如永乐年间的涂、道统年间的俞道淳、唐等。北京图书馆现存正统道教藏书3部半。另一个在南洋图书馆；上海图书馆只有一半。还有青岛博物馆收藏的万历出版物《道藏》。清康熙年间，彭定康收集了200多种道教书籍，编纂了《道教书籍集》，按28家字号分为28集，共200多册。记载了重要的道教经典、先人著作、真人真事、科学仪器戒律、碑志列传等，其实都是道经的删节本，包括明代道经以外的晚出书。嘉庆年间，江编纂了1卷《道藏目录》。光绪三十二年(1906)，因原版稀有，成都二仙庵道院再版，增编何龙祥主编的《道藏集解》五卷，并与世界同步刻制《道藏集解补》和《女旦集》。此外，闵一德主编的《道藏1集》和小萧公主编的《道藏精华》都是对《道藏》的补充。《道藏精华》收录道经古籍、孤本、笔记800余种，注释书1000余种。其藏书之广、内容之精、版本之贵、选刊之精，堪称四绝。由于藏书卷帙浩繁，查找起来很不方便。1953年7月，翁杜鉴根据《正统道藏》、《万历续道藏》、《道藏目录》、《道藏集解》的内容，编了一部《道藏副标题》一书，分为分类、经典、作家、史传。1949年，陈撰写了《道教藏书源流考辨》(1963年更新再版)，对三窟四辅经的源流、教学，历代道教书目、道教藏书的编刻等作了大量考证。