历史互相揭露。
秦始皇听说侯生和鲁生逃走了，勃然大怒，说:“我待鲁生很好，赏赐得很好，他们却在背后诽谤我，说我缺德。”。我派人去问咸阳的这些儒生，被告知有些是在散布谎言，混淆人心。因此，始皇帝下令有关部门逮捕一些散布谣言的学者。在严刑拷打下，这些人互相揭发，咬出了460多名污蔑秦始皇的儒生。在秦始皇的命令下，460多名儒生被活埋在咸阳。这是公元前212年发生的事情。侯生和陆生是受秦始皇之命求仙求药的方士，但他们不是纯粹的儒生。他们的逃跑可能是因为怕找不到仙药被查，但他们对秦始皇的评价都是对的。嬴政因咸阳士人逃跑而迁怒于他们，一口气活埋了460多人。
葬儒还有一件事:由于秦始皇把文字统一为大篆和官字，很多中国人诽谤和怨恨，秦始皇怕天下不顺从，就把儒生叫到咸阳，七百多人被召来，都拜他们为郎官。然后，秦始皇秘密命令亲信在骊山谷温暖向阳的地方种瓜。瓜熟的时候是冬天，让人玩了:立山居然冬天也种瓜！秦始皇下令所有学生临死前都要去参观。他们到达山谷后，争论不休。突然，泥土和石头都在地下，他们都被压死了。骊山谷后来被称为坑儒谷。在汉代，它被称为儒家思想的故乡。经考证，儒教之坑是陕西临潼西南五里的一条狭长深谷，符合实地的这一记载。
有人认为秦始皇把儒学埋在骊山其实是咸阳的错误。因为李山坑儒之说，只见于东汉初年魏宏所著《中国古代文学著作序》中，且未注明出处。其余的古籍都没有这样的记载。但魏宏是汉光武帝时期的著名学者，是一位治学严谨的史学家和训诂学家。他在这篇序言中披露了此事，以他的学术态度，应该不是信口开河。而且《史记》中记载的秦始皇咸阳孔坑与魏宏记载的历山孔坑在位置、人数、埋葬方式等方面都有所不同。这样看来，秦始皇至少两次被儒家埋没了。
司马迁在《史记·儒林列传》中确实说过秦始皇焚书坑儒，也揭露过污蔑秦始皇的侯生和吕生不是儒生，而是为秦始皇寻找长生不老药的两个方士。而且据说骗儒是秦始皇死后100多年才出现的，所以有人说骗儒应该是西汉士人出于对秦始皇暴政的愤怒而强加给他的一个伪词。然而，为秦始皇翻案的人忽略了《史记》、《儒林外史》中的一个细节。秦始皇焚书坑儒后，其长子傅肃谏曰:“天下之始，黔首未聚于远方。学生皆诵孔子之教，今皆重法之教，恐天下不安。”只看它。他的意思是，现在世界刚开始，远方的人未必信服。这些儒生都在向孔子学习。陛下如此严惩他们，恐怕天下人都会因此而惊恐不安。这个时候，秦始皇没有听最不好听的。当他听到这个建议时，他很生气。他把傅肃赶出咸阳，让他在蒙恬北部的军队里当监军。这一举动导致了后来沙丘的变化。
司马迁在详细记载秦始皇在咸阳坑儒的时候，只是笼统地说都是儒生，并没有明确说明坑的都是儒生。傅肃谏时，说明了全体学生的意思:全体学生背诵孔子的教诲。也就是说，学生是儒家的代表人物孔子的弟子，是孔子的弟子，也就是儒生。
当然，因为秦始皇喜好鬼神，派人到处求神药，所以一些儒生爱上了它，把自己变成了方士，以此来获取财富。秦始皇被坑的学生中，很多儒生很可能是方士，所以司马迁说秦始皇烧诗书坑术士。反正当时的方士大多也是学者，也算是准儒生吧。根据学生都是诵法孔子的事实，当然被秦始皇抛弃的学生中也有一些术士，但大部分都是诵法孔子的儒生。说秦始皇焚书坑儒没有错。
如果秦始皇手下的人都是奸诈狡诈的方士，这件事对儒生的影响可能不会这么重，造成的社会影响可能也不会这么坏。事实上，焚书坑儒事件发生后，儒生就站到了秦始皇的对立面，有的甚至公开参加反秦起义军。司马迁在《史记·儒林列传》中说得很清楚:到秦末，六艺缺失。陈涉国王也在，而陆竹如则手持孔子的礼器返回王晨。于是，孔甲成了陈涉博士，他和所有的人一起死去了。陈涉开始是一个人，洪水淹没了瓦和米驻军，10月下旬又淹没了楚王，但很浅，他不到半岁就死了。而钱先生的弟子们却拿着孔子的礼器，委托他们当大臣。为什么？他和秦一起烧了他的产业，又怨恨陈。
在司马迁看来，秦始皇焚书坑儒，是对当时人们学习六艺的致命一击。陈胜起义时，山东儒生毅然加入陈胜起义军。孔子的第八代孙孔子(A)在陈胜当了医生，后来随陈胜而死。陈胜只是一个民工，但在这些儒生的帮助下，他在十天之内建立了自己的政权。儒生之所以不顾君主大义跟随陈胜造反，是因为秦始皇的文化专制主义政策剥夺了他们进行学术研究的权利，使他们不堪忍受，最终跟随陈胜走上了武装反抗秦朝暴政的道路。秦始皇焚书坑儒，以为这样就可以愚弄天下百姓，永保江山。没想到，山东大乱之前骨灰未寒。秦始皇葬身儒教才四年，秦始皇梦寐以求的传播天下的根基就分崩离析了。