吉木萨尔县的历史沿革
东汉永平十七年(74)，汉政府派吴率数百人定居吉木萨尔县北亭古城。
唐朝建立后，唐朝政府对西域采取了一系列政治、军事等统治政策。
贞观十四年(640)，唐政府在吉木萨尔县设汀州，管辖东有普雷海(巴里坤湖)，西有石齐河(泾河)，北有沙漠，南有天山的广大地区。建国之初有金曼、莆雷、轮台三县，州辖金门市。后来又有西海郡汀州所辖四郡。金曼县位于吉木萨尔县境内，下辖两个乡镇，县与州共管金曼市。
长安二年(702)，武则天政府为了加强军事防御，提升汀州为北庭都城，政府统治北庭城(金满城)。它既是军事指挥机关，又是行政机构，是天山北麓的政治军事中心和交通枢纽。然而，随着都护府建筑规格的提高，金曼郡的建筑被取消了。
景云二年(711)，北庭都护府升级为北庭都护府，2都护府，23都护府，辖益州、西州、汀州，成为唐朝在西域的最高军事指挥机关，管理天山北麓至西至咸海的广大地区的军事，辖兵十余万。
乾隆二十四年(1759)设吉木沙巡抚，管理民屯粮食收支，监督军粮发放和地方防务。
乾隆三十二年(1767)，清政府开始在吉木萨尔垦荒，绿营775人，土地2万亩。
乾隆三十七年(1772)，纪昀、于等即墨撒派知府，再设驻防。看到北亭老城损毁严重，无法修复，他们放弃了。于是在子木撒建了开安城。并先后在吉木萨尔沿官道修建了裕昌堡、石河堡、惠来堡，设有总参谋部、警备司令部、总参谋部、总参谋部，经营荒地，管理克伦族，并派驻数千绿营兵防守。隶属乌鲁木齐府尹军政指挥，民政隶属镇西府奇台县管辖。
乾隆四十一年(1776)，清政府撤销对吉木萨尔的检查，建立县城，隶属迪化府阜康县。县丞协助知府管理十里井与白洋河之间及东部大泉之间的民政。
光绪二十年(1894)，重建开安城，改称抚远城。
光绪二十八年(1902)，吉木沙县升格为县，以市命名为抚远县，辖抚远市，隶属真帝路帝华府，后隶属帝华路。
1950成立富源县人民政府，隶属迪化专员公署。
1954年2月，经国务院批准，富源县更名为吉木萨尔县，隶属乌鲁木齐专员公署。
1958年5月，撤销乌鲁木齐地区，吉木萨尔县自此隶属昌吉自治州。