星际背景故事
所以幽灵被迫与凯瑞甘联手寻找启动神殿能量所必需的两块水晶。当他们回来时，阿达里斯发动了反对黑暗圣堂武士和凯瑞甘联盟的起义。然而，起义失败了，阿达里斯也被凯瑞甘杀死了。这时，勇气号终于明白了凯瑞甘的真正意图是杀死夏库拉星上的脑虫，这样她就可以自己控制虫群了。尽管知道启动神殿会让凯瑞甘如愿以偿，但此时白灵别无选择。坦尼斯和泽拉图终于启动了神殿，扫除了夏柯拉斯上所有的外来昆虫。
在人类故事的第二阶段，玩家跟随杰拉德·杜加尔和阿列克谢·斯托科夫带领地球联合议会的远征舰队进攻泰隆帝国。起初，舰队遇到了一个反对帝国的特工，萨米尔·杜兰，斯托科夫视他为特别顾问。在杜兰的帮助下，舰队赢得了第一次胜利。UED很快在前联邦首都行星塔桑尼斯发现了“隐藏的能量干扰器”——一种可以干扰外星人通信的设备。
杜兰说服了杜格尔指挥官摧毁它，但斯托科夫在最后一刻阻止了它[14]。远征军随后开始进攻帝国首都科哈星球。玩家击败了星球上的守军，但大角星人蒙斯克本人却被吉姆·雷诺兹率领的小型精灵舰队解救。UED跟着他们来到了阿尔星球，但由于杜兰擅自离开，他的行动受到了不同昆虫的严重干扰，蒙斯克趁机逃脱。
杜兰的举动震惊了斯托科夫，杜格尔并没有意识到杜兰的背叛。斯托科夫带领一个小组重建了秘密干扰器。杜格尔听了杜兰的话，派他去杀斯托科夫。在死前，斯托科夫说出了真相:杜兰是真正的敌人，他在为凯瑞甘服务。玩家随后挫败了杜兰破坏隐藏能量干扰器的阴谋，杜兰逃脱。在秘密能量干扰器的力量帮助下，远征军终于在查尔星球的外星世界用强效药物抓获了成长中的新主人。
在最后一章中，莎拉·凯瑞甘带领外星人在星区赢得了最后的胜利。入侵UED削弱了该地区所有原有的力量。在剧情开始时，凯瑞甘和杜兰与吉姆·雷诺兹、菲尼克斯和芒斯克达成了不情愿的联盟，他们一起摧毁了隐藏的能量干扰器。随后他们筹集了大量资源对科哈星球发动反攻，并很快突破了UED的防线。然而，凯瑞甘随后背叛了她的盟友，杀死了凤凰城和蒙斯克的将军埃德蒙·杜克，并使帝国军遭受重创。
后来，凯瑞甘和杜兰在夏天来到了柯拉斯星球，劫持了瑞泽格尔，并强迫泽拉图帮助外星昆虫消灭了新主人，使得所有外星昆虫都服从了凯瑞甘的统治。之后，泽拉图试图强行将里泽格夺回，但在逃跑时被这名球员击败。拉图尔意识到鲁伊·西格已经不可挽回地被凯瑞甘感染了，所以他杀死了鲁伊·西格，离开了查尔行星。
在流浪过程中，他偶然发现杜兰正在进行一项不为人知的精神-异虫基因混合实验。这时，由UED、帝国和坦尼斯率领的精灵舰队大规模攻击凯瑞甘。尽管如此，外星昆虫还是彻底击败了三支舰队，使凯瑞甘成为了该星区真正的统治力量。
在剧情的最后，UED远征军被外星昆虫彻底摧毁，蒙斯克回到科哈星球重建他的帝国，坦尼斯回到夏·柯拉斯重建幽灵曾经辉煌的文明，而雷诺和泽拉图则独自在宇宙的不同方向游荡。
扩展数据:
原版星际争霸故事分为三章，依次以人类、外星人、精灵为故事主线——
1，人族
《星际争霸》中的“人”是未来世界中人的想象版本。根据游戏手册的内容，20世纪后期人类文明飞速发展，随之而来的人口问题迫使国际组织“地球联合理事会”(UED)流放了一批“人类中的坏分子”，包括罪犯和基因突变者。
最终，他们到达了银河系中心的Copluxing区，并很快陷入了一场政治纷争。一个名为“人类联邦”的组织最终获胜，成为星区最强大的政权。与此同时，一个反政府组织“凯哈之子”也在积蓄力量。然而，就在游戏开始前，公元2499年，联邦发现几个边境殖民地被一种外星生物感染了，然后Spirit烧毁了这些星球，以避免感染的扩散。由于两种外星人同时入侵，人族陷入极度恐慌。
2.虫族(Zerg)
异虫是古代萨尔纳迦人创造的，通过吸收其他生物的基因来进化自己。所有的昆虫都服从于智慧生命的“主人”。虫群没有思想，服从主人控制的脑虫的命令。它们可以在任何极端环境下生存，依靠不断的选择性吸收和同化高等生物，达到基因的完美和纯粹。它们的部队都是由幼虫孵化出来的，不同昆虫的栖息地周围都有一种有机物“虫苔”，不同昆虫的建筑也必须建在虫苔上。
3.精神。
精灵是宇宙中高度发达的智慧生命种族。他们被认为是宇宙中科技最先进的种族，掌握了曲速门、等离子盾等技能。在远古时代，他们已经被萨尔那加人改造，从而产生了以阿尔星球为中心的完整的种族精神联系。
灵也分为两个社会，信仰“Khala”(意为升天之路)的传统灵和流亡的黑暗圣堂武士。勇气号的建筑也依赖于精神连接，所以必须建在水晶塔的能量范围内。一旦水晶塔被摧毁，建筑就无法正常运作。