整个人类基因组是如何测试的?

我们身体的每个细胞都有一套32亿碱基对的遗传指令。

解读这些说明是一项极其艰巨的任务,但对我们理解自己却有着深远的意义。

1990年,由20个国际研究中心组成的合作团队开始完成世界上最大的生物工程。

人类基因组计划预测,这项基因测序工程将耗时长达15年,耗资30亿美元。

然而,在该项目预计完成的七年前,一家名为Celera的私营公司宣布,他们可以用更少的资金在三年内完成该项目。

两个团队试图合作,但由于对研究结果的法律和伦理分歧,谈判最终失败。

于是他们之间的竞争开始了。

虽然两个团队在基因测序中使用了相同的技术手段,但他们的测序策略却完全不同。

区别在于以下关键步骤:

首先,人类基因组计划的计划是将整个基因图谱分成更小更易操作的片段,每个片段由654.38+0.5万个碱基对组成,相邻片段之间有少量重叠。

将每个DNA片段注射到人工培养的细菌染色体中,进行复制,从而得到指纹图谱。

指纹可以向科学家展示那些未知序列的重叠部分。利用这些重叠的片段作为线索,研究人员标记了染色体中的每个片段,以获得连续的图谱。

这个过程持续了六年。

世界上所有对这些基因片段进行测序的实验室都遵循以下两条标准:研究成果属于全人类,对世界各国开放。

在所有实验中,基因片段被随机分成更小的重叠的1000个碱基对。

随后,他们使用“桑格测序法”(注:双脱氧链终止法)对每个片段中的碱基逐一进行测序(即A、T、C、G)。

这种严格的图谱测序方法被称为“分层鸟枪测序法”,可以将错误组合的风险降到最低。

这些基因的重复组合有很大的风险,比如人类基因组。

人类基因组计划的这种“安全胜于遗憾”的原则,与赛莱拉的“全基因组鸟枪测序法”形成了鲜明的对比。

因为Celera完全跳过了atlas阶段,有些人认为这是一个有勇无谋的战略。

他们将整个基因组直接切割成许多小而重叠的片段。一旦这些小片段被“桑格测序”,Celera将采取一种非常冒险的方法,即利用那些重叠的部分直接重组基因。

但也许他们的策略并不是一场赌博,因为猜猜是谁最先完成了可以在网上免费获得的图集?

人类基因组计划研究中的第二个标准是在24小时内公开研究中收集的数据。

因此,从65438年到0998年,世界各地的科学家都使用经过验证的“桑格测序法”对各种遗传基因进行测序。

终于,经过三年艰苦的测序重组,竞赛有了结果。

2001年2月,双方同时发布了超过90%的人类基因组草图,比最初预测的时间提前了好几年。

这场比赛不分胜负。

人类基因组计划及时共享数据并不常见。当科学家能够分析并公布结果时,他们更愿意公布研究数据。

然而,人类基因组计划的这一实践加速了研究进程,促进了研究领域前所未有的国际合作。此后公私领域的研究深入发展,使得很多基因相关疾病得以检测,测序方法也不断完善。

如今,只需要几天就可以对一个人的所有基因进行测序。

然而,能够解读基因只是第一步。要了解大多数基因的功能以及它们是如何被控制的,我们还有很长的路要走。

这些任务将交给我们下一代有进取心的研究人员。

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