神仙谱系的历史进程
其早期经典《太平经》不仅将神仙和真人确定为崇拜对象，还将儒家圣人和圣贤列入神仙谱系，并将其分为六等:“一为神，二为真人，三为仙，四为道，五为圣，六为贤。”据说“这都是有助于天治的。”神为天主，真人为地主，神仙为风雨主，道士主教好坏，圣人顾念百姓，圣贤辅佐圣人，管民录助六合。“此时的神仙谱系比较粗糙，呈现出初始阶段的原始状态。这一时期的道家主要流派五斗米道称老子为老先生，并建立了天、地、水三官。除此之外，它并没有建造其他的神。这与当时武斗米道不重视偶像崇拜有关。如张路(或云)的《老子思尔注》就强调老子的道是“无名”、“无象”的观点，反对给道一个名称、一个形状。所以这个时期创造的神很少。南北朝时期是道教构建大量神仙并进行初步整理的时期。
鲁重修南天师道(原五斗米道)时，仍秉承三大传统，认为“大道空寂，绝形也。”道士祭神的主要场所“敬室”，要讲究“清空”“扫精，永留神明，只设香炉、香灯、刀。”
然而，当寇对北路进行改革时，却与这一观点完全相反。一方面，他以太上老君的名义，确立了自己“天师”的地位，表明他仍然尊太上老君为教首。另一方面，他为自己的神权创造了一个新的神。除了太上老君之孙李普文颁发的《创造鲁图真镜神话》之外，“两仪之间有三十六日，其中有三十六宫，宫中有一主。
南朝梁朝道士洪涛写了一张《真灵方位图》，意在把这些混乱的神仙谱系整理得更有条理。他按照“阶级之序”、“贵贱之序”的世俗原则，将五百多个神、俗世之域、神仙、鬼怪排列成七个顺序。在第一中位(即第一神阶，下同)，玉清元石天尊为主神，在第二中位，陈愉黄轩大道君为主神，在第三中位，太金池阙帝君为主神，在第四中位，太清太上老君为主神，...最后，在第七个中间位置，杜锋是主神尹蓓皇帝。每个中位之下又有左、右、女真人、散、散位，分别容纳几个神、俗世、仙、鬼，编撰了道教史上第一部神谱。
这部族谱虽然不是完全系统的，但却把一个非常复杂的神仙群体带入了七系，这无疑是从原来的乱序向前迈进了一大步，为后来的族谱编纂奠定了基础。
还有一个问题就是各派崇拜的最高神不一致，需要协调。五斗米道(石天道)和楼观道一直将太上老君视为最高神，上清派和灵宝派则将元始天尊和太上大道君(或灵宝天尊)视为最高神。这种情况也不利于道教的传播。有些道士模仿佛教的“三体”理论，把各派侍奉的最高神组合在一起，形成可以共同接受的最高神，也就是后来的最高神“三清”三位一体。陶弘景的《真实精神位置图》显示了这种倾向。第一，在元神之下，所列的名字都是“天帝”、“道君”、“袁俊”，没有属地、人、鬼。第二中位，在大道下，包括魏、、等上清派创始人；第三位，金阙皇帝之下，包括了徐来乐、葛玄等灵宝派创始人。第四，在老先生之下，收录了以张玲为代表的天师道创始人。四大中间派融合成一个至高无上的神，可以解决各派原有的矛盾。实际上，这四神的名字和显要地位已经具备了“三清”的特征，它们实际上是“三清”的雏形。因此，《真灵位图》在道教神谱的形成中具有重要的历史意义。隋唐五代是三清最高神的地位最终确立，神仙谱系继续编修的时期。
到了唐代，道教受到崇拜，老子被尊为“轩辕大帝”、“圣祖大道上的轩辕大帝”、“大圣祖上的轩辕大帝”，圣祖庙(老子庙)遍布天下。所以在唐初、中期的道观中，仍然只有天坛或元代的老君庙，而没有三清寺。中期以后，三清殿和三清观的名称开始出现在记载中。徐铉《云州清江县重建三清笔记》载，此观原是为纪念吴孟、许逊两位真君而作，原为草堂道元。“世远，益增修。”如杜光庭《道门柯凡全集》第1至3卷中，三清之后列出的神灵有:玉帝、魏紫天地、北斗九行星君、三观、无棣、九福四君、六十甲子一生的核心碑邢俊、玄中驱魔人、三天驱魔人等。第四至第六卷列出如下:尚高玉帝，三十六天帝，东华，南极，西陵，北镇，玄学中的驱魔人，三天驱魔人，日月九妖，陈楠北斗，三关，无棣，生命的核心古迹邢俊，东岳四明，名山大洞，三界仙女，等等。宋代是道教神仙谱系的最后一个编纂时期。
北宋真宗和惠宗是著名的道教皇帝，他们做了很多荒唐事。为了满足神的需要，大臣和道士奉命整理道教仪式。《宋史·王钦若传》记载，王钦若曾撰《存万魂作真图》、《罗田大义》。《凌琳传》是一部反映过去神仙身体和陶的书，其中记载曾“受命修改一个黄玉和绿玉的仪器，安排三界的神圣，并纠正的子书。”林灵素的“整理三圣所”工作对道教神仙谱系的定型起了重要作用，南宋金允中编撰的《清·灵宝大法》中斋戒的神仙名单也随之改变。根据其性质和等级，其第39卷所列的360位神仙名单可分为以下11个等级:
(1)三清和于斯；
(2)南极仙人，东极救苦救难神，木工岛君，金娘袁俊，三十二帝；
(3)太乙、太阳、月亮、五星、北斗、二十八宿；
(4)五帝三官四圣；
(5)历代流传下来的著名法师；
(6)魔王、神王、仙官；
(7)杜锋的五岳和诸神；
(8)扶桑大帝和水府诸神；
(9)舒天学园、驱魔学园、傅雷等学园和诸神学园；
(10)各种功曹，使者，金童，玉女，香官，官仆等。
(11)镇神，土地和他们的神。当然，道教书籍中所包含的神仙体系并不是完全统一的。而南宋《太上皇黄志达斋成仙礼》和宁全真《灵宝学记》所载的成仙制度，在主神及其顺序上差别不大。因此，金允中的《上清灵宝大法》是神仙谱系的代表，是道教神仙谱系最终编纂完成的标志。